Continuum fluvial selon une perspective géomorphologique et écosystèmique
Transport longitudinal et sédimentation de matières organiques et de contaminants
La distribution spatiale des organismes aquatiques dans les différents habitats fluviaux et les contraintes anthropiques
Les effets de la physiographie, de l'utilisation du bassin versant et du changement climatique sur la qualité de l'eau et des milieux aquatiques et riverains
Le suivi environnemental, les actions de restauration écologiques, la récupération et l'évaluation du risque écotoxicologique.