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RESEAU TROPHIQUE DE L'ANSE DE L'AIGUILLON - DYNAMIQUE ET STRUCTURE SPATIALE DE LA MACROFAUNE ET DES LIMICOLES HIVERNANTS

Année de parution : 1-01 00:00:01
Auteur(s) : DELPHINE DEGRE
Maître d'ouvrage : UNIVERSITE DE LA ROCHELLE
Maître d'œuvre : UNIVERSITE DE LA ROCHELLE

Nature(s) : THESE
Thème(s) : FAUNE

Sommaire

Introduction generale

-. Introduction generale

-.1. Problematique generale

-.1.1. Etude spatio-temporelle des ecosystemes cotiers et estuariens

-.1.2. Approches hierarchiques

-.2. Description des systemes humides

-.2.1. Les zones humides

-.2.2. Fonctionnement des vasieres intertidales sous influence estuarienne

-.2.3. Les principaux compartiments du reseau trophique intertidal

-.2.4. Fonctionnement du reseau trophique et structure spatiale et temporelle de chaque compartiment

sous des controles á top-down â et á bottom-up â.

-.2.5. Capacite d'accueil et gestion des espaces pour les limicoles hivernants

-.3. Objectifs de la these

-.3.1. Objectif global, site et modele d'etude choisis

-.3.2. Plan de la these

Partie 1 : L'anse de l'Aiguillon

1. Caracteristiques geographiques, hydrologiques, geologiques et morphologiques

1.1. Introduction

1.2. L'anse de l'Aiguillon : entite geographique

1.2.1. Localisation du site d'etude

1.2.2. Trois entites geographiques connectees

1.3. Hydrologie du site 26

1.3.1. Les cours d'eau

1.3.2. L'hydrodynamisme

1.4. Les phenomenes geologiques a l'origine de l'anse

1.4.1. Geologie generale de la region

1.4.2. Morphogenese et sedimentation de l'anse de l'Aiguillon

1.4.3. Les sediments de l'anse de l'Aiguillon

1.5. Cinq entites morphologiques de l'anse de l'Aiguillon 36

1.5.1. La riviere de Marans

1.5.2. La basse slikke

1.5.3. La moyenne slikke

1.5.4. La haute slikke

1.5.5. Le schorre

1.6. Conclusion

2. Les enjeux socio-economiques et ecologiques

2.1. Introduction

2.2. Les enjeux socio-economiques

2.2.1. La conchyliculture

2.2.2. Les activites de peche

2.2.3. Les activites recreatives

2.2.4. Les activites agricoles

2.2.5. La demoustication

2.3. Les enjeux ecologiques

2.3.1. Fonctionnement et productivite des vasieres intertidales

2.3.2. Biodiversite de la faune marine

2.3.3. Interet faunistique du milieu

2.3.4. Interet floristique du milieu

2.4. Vers une gestion integree du milieu

2.4.1. Divers amenagements proposes

2.4.2. Historique des reserves naturelles

2.4.3. Statut juridique des reserves naturelles

2.5. Conclusion

3. Structure spatio-temporelle des parametres biosedimentaires de l'anse de l'Aiguillon

3.1. Introduction

3.2. Materiel et methodes

3.2.1. Strategie d'echantillonnage et materiel utilise

3.2.2. Analyse des parametres biosedimentaires

3.2.3. Analyse multivariee des donnees

3.3. Resultats cartographiques

3.3.1. Granulometrie et diametre moyen des sediments

3.3.2. Teneur en carbonates des sediments

3.3.3. Teneur en eau et salinite de l'eau interstitielle des sediments

3.3.4. Teneur en matiere organique des sediments

3.3.5. Teneur en pigments des sediments

3.4. Typologie des sediments de l'anse de l'Aiguillon

3.4.1. Analyses des correlations et ACP par saison

3.4.2. Analyses hierarchiques et multivariees des caracteristiques biosedimentaires toutes saisons

confondues

3.5. Resultats dynamiques sur la haute slikke

3.6. Discussion

3.6.1. Granulometrie fine, homogene dans l'espace et le temps

3.6.2. Teneur en eau des sediments.

3.6.3. Teneur en carbonates des sediments

3.6.4. Temperature et salinite..

3.6.5. Teneur en matiere organique et en pigments des sediments

3.7. Conclusion

Partie 2 : La malacofaune benthique

4. Diversite et structure spatiale de la malacofaune sur l'anse de l'Aiguillon

4.1. Introduction

4.2. Materiel et methodes

4.2.1. Cartographies de la malacofaune benthique

4.2.2. Indices de frequence, de richesse specifique et de diversite.

4.2.3. Definition des stocks disponibles, ingestibles et profitables

4.2.4. Analyses des donnees

4.3. Resultats

4.3.1. Diversite en mollusques sur l'ensemble de l'anse de l'Aiguillon

4.3.2. Structure spatiale des stocks de mollusques.

4.4. Discussion

4.4.1. Richesse et diversite specifique des mollusques

4.4.2. Les peuplements malacologiques

4.4.3. Les principaux groupes trophiques

4.4.4. Quelques facteurs influencant la distribution des mollusques.

4.4.5. Repartition spatio-temporelle des stocks de mollusques

4.5. Conclusion

5. Dynamique des stocks de bivalves, proies pour les limicoles sur l'anse de l'Aiguillon

5.1. Introduction

5.2. Materiel et Methodes

5.2.1. Methodes d'échantillonnage .

5.2.2. Methode de suivi de la dynamique des populations de bivalves

5.2.3. Analyses statistiques des donnees

5.3. Resultats

5.3.1. Evolution des abondances des bivalves de la haute slikke

5.3.2. Repartition verticale des bivalves de la haute slikke

5.3.3. Dynamique des populations des trois principales especes de bivalves .

5.4. Discussion

5.4.1. Disponibilite des bivalves

5.4.2. Accessibilite des bivalves

5.4.3. Detectabilite des bivalves par leurs predateurs

5.4.4. Ingestibilite et digestibilite des bivalves par leurs predateurs

5.4.5. Profitabilite des bivalves

5.4.6. Recrutement et productivite des bivalves.

5.5. Conclusion

Partie 3 : Le peuplement de limicoles

6. Diversite et dynamique des limicoles

6.1. Introduction

6.2. Materiel et methodes

6.2.1. Principales voies de migration des limicoles

6.2.2. Comptages

6.2.3. Sources des donnees

6.2.4. Principales especes etudiees

6.3. Diversite et importance des limicoles hivernant sur l'anse de l'Aiguillon

6.3.1. Diversite des limicoles

6.3.2. Importance internationale de la reserve naturelle de la baie de l'Aiguillon pour l'hivernage des

limicoles

6.3.3. Importance relative des 8 principales especes

6.4. Dynamique des effectifs de limicoles

6.4.1. Dynamique a long terme des effectifs de limicoles hivernant en Europe

6.4.2. Dynamique a long terme des effectifs de limicoles sur le littoral francais

6.4.3. Comparaison entre les dynamiques a long terme des effectifs de limicoles sur le littoral francais,

sur le Centre-Ouest et sur la baie de l'Aiguillon.

6.4.4. Dynamique saisonniere a moyen terme des effectifs de limicoles sur la reserve de la baie de

l'Aiguillon

6.4.5. Phenologie des migrations des limicoles sur l'anse de l'Aiguillon

6.5. Discussion et conclusion

7. Dynamique spatiale de la repartition des limicoles sur la reserve naturelle

7.1. Introduction

7.2. Materiel et methodes de cartographie des repartitions

7.2.1. Protocole de comptage des limicoles a maree basse

7.2.2. Mise en place de bases de donnees geo-referencees et de cartographies

7.2.3. Preparation des tableaux de donnees pour les analyses multivariees

7.2.4. Analyses statistiques et multivariees

7.3. Resultats : repartitions des limicoles a maree basse

7.3.1. Cartographies des repartitions des limicoles a maree basse durant 3 hivers

7.3.2. Comparaison inter-hivers des repartitions a maree basse

7.3.3. Influence des facteurs trophiques et environnementaux sur les repartitions a maree basse des

limicoles a leur arrivee sur l'aire d'hivernage

7.4. Discussion : facteurs influencant la repartition des limicoles

7.4.1. Choix d'un site d'accueil

7.4.2. Precautions pour l'interpretation des donnees

7.4.3. Rythme d'activite

7.4.4. Repartition des limicoles selon la disponibilite de leurs proies

7.4.5. Repartition des limicoles selon lfaccessibilite de leurs proies

7.4.6. Repartition des limicoles selon la productivite et la profitabilite des proies

7.4.7. Repartition des limicoles selon la nature des sediments et des apports en eau.

7.4.8. Repartition des limicoles selon la nature du site d'accueil.

7.4.9. Repartition des limicoles selon leur comportement

7.5. Conclusion

8. Ecologie alimentaire et estimation des consommations par les limicoles

8.1. Introduction

8.2. Materiel et methodes

8.2.1. Capture et mensuration des limicoles

8.2.2. Methodes d'estimation de la consommation des limicoles

8.2.3. Methodes d'estimations des stocks de mollusques proies des limicoles

8.3. Resultats

8.3.1. Mensuration des limicoles captures

8.3.2. Estimation des consommations.

8.3.3. Estimation des stocks consommables

8.3.4. Estimation des stocks consommes et renouveles

8.4. Discussion : Ecologie alimentaire des limicoles

8.4.1. Differentes strategies alimentaires

8.4.2. Consommation par les limicoles

8.5. Conclusion 295

Partie 4 : Le reseau trophique

9. Analyse des rapports isotopiques naturels du carbone et de l'azote au sein du reseau trophique de

l'anse de l'Aiguillon

9.1. Introduction

9.2. Materiel et Methodes

9.2.2. Strategie d'echantillonnage et traitement des echantillons

9.2.3. Analyses des donnees

9.3. Resultats

9.3.1. Variabilite des signatures isotopiques des ressources primaires.

9.3.2. Variabilite des signatures isotopiques fÂ13C et fÂ15N de la macrofaune

9.3.3. Variabilite du fÂ13C et du fÂ15N chez les limicoles de l'anse de l'Aiguillon

9.3.4. Organisation du reseau trophique dans un diagramme dual Ý13C / Ý15N

9.4. Discussion

9.4.1. Diversite des producteurs primaires et saisonnalite de leurs signatures isotopiques

9.4.2. Variabilites trophique, ontogenique et physiologique des signatures isotopiques des consommateurs

primaires et secondaires

9.4.3. Ressources alimentaires des limicoles pendant leur mue ou pendant leur hivernage

9.4.4. Critiques et limites de lfetude des reseaux trophiques au moyen des isotopes stables

9.5. Conclusion

10. Modelisation des flux de carbone dans le reseau trophique de l'anse de l'Aiguillon : approche

saisonniere par analyse inverse

10.1. Introduction

10.2. Materiel et Methodes

10.2.1. Analyse inverse

10.2.2. Le modele conceptuel et les donnees

10.2.3. Indices synthetiques

10.2.4. Les indices d'analyse des reseaux, outils pour comparer differents systemes

10.2.5. Analyses de sensibilite

10.3. Resultats

10.3.1. Les flux de carbone estimes par le modele

10.3.2. Les activites et debits du systeme

10.3.3. L'analyse des reseaux

10.3.4. Analyses de sensibilite

10.4. Discussion

10.4.1. Des processus a preciser

10.4.2. Un systeme peu controle par les predateurs superieurs.

10.4.3. Comparaison du reseau trophique de l'anse de l'Aiguillon avec d'autres par l'analyse des reseaux

10.5. Conclusion

Conclusion generale

-. Conclusion generale

-.1. Objectifs de la these

-.2. Synthese des principaux resultats

-.2.1. l'anse de l'Aiguillon

-.2.2. La malacofaune benthique

-.2.3. Les peuplements de limicoles

-.2.4. Fonctionnement du reseau trophique

-.3. Fluctuations de la capacite d'accueil

-.4. Perspectives de recherche

-.4.1. La signature isotopique d'especes bio-indicatrices.

-.4.2. Amelioration du modele de reseau trophique par analyse inverse

-.5. Gestion de la reserve et propositions de suivi

-.5.2. Propositions de suivi

-. Annexes

-.1. Les zones humides

-.1.1. Definition et typologie des zones humides

-.1.2. Diverses fonctions remarquables des zones humides

-.1.3. Une productivite et une biodiversite elevees

-.1.4. Une anthropisation massive d'un patrimoine en danger

-.2. Legislation sur les zones humides

-.2.1. Les textes francais du Droit de l'Environnement et le Plan National d'Action

-.2.2. Les textes du Conseil des Communautes Europeennes

-.2.3. Les conventions internationales.

-.3. Liste des especes de macrofaune rencontrees (hors mollusques)

-.4. Tests d'homogeneite des variances (Bartlett) sur les donnees de populations des bivalves

-.5. Estimation du niveau trophique a partir des rapports isotopiques de l'azote

-. Bibliographie

Mot(s) clé(s) : espèces patrimoniales, habitats, invertébrés, oiseaux

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