Centre documentaire
APPROCHE QUANTITATIVE DE LA FONCTION DE NOURRICERIE DES SYSTEMES ESTUAIRES-VASIERES - CAS DU BAR EUROPEEN DANS CINQ NOURRICERIES DU PONANT - ESTUAIRE DE LA SEINE ESTUAIRE DE LA LOIRE...
Année de parution : 1-01 00:00:01
Auteur(s) : EMMANUEL P. PARLIER
Maître d'ouvrage : IFREMER - UNIVERSITE DE LA ROCHELLE - CNRS CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
Maître d'œuvre : IFREMER - UNIVERSITE DE LA ROCHELLE - CNRS CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
Nature(s) : THESE
Thème(s) : FAUNE
TABLE DES MATIERES
INTRODUCTION GENERALE ET CONTEXTE SCIENTIFIQUE (ETAT DE L'ART).
1. QUELLES SONT LES ESPECES FREQUENTANT LES SYSTEMES ESTUAIRES-MARAIS SALES INTERTIDAUX DE
LA FAÇADE OUEST DE LA FRANCE ET QUELLE EST LA DYNAMIQUE DE LEUR COLONISATION ?
1.1. Quelles sont les compositions spécifiques des différentes guildes fonctionnelles ? Existe-t-il des
variations spatiales et/ou temporelles de la composition et de l'organisation des peuplements ?
1.2. Le type de milieu a-t-il une incidence sur l'organisation des peuplements ?
2. COMMENT CARACTERISER LA CAPACITE D'ACCUEIL DES DIFFERENTS TYPES DE MILIEUX POUR LES
JUVENILES DE L'ANNEE ?
2.1. Abondances et structure de populations.
2.2. Croissance et performance de croissance.
3. COMMENT CARACTERISER LE ROLE TROPHIQUE JOUE PAR LES MARAIS SALES POUR LES JUVENILES DE
BARS EN FONCTION DES DIFFERENTS SITES ?
3.1. A l'échelle d'une marée : les régimes alimentaires, des indicateurs instantanés
3.2. A l'échelle d'un mois ou d'une saison : les suivis des rapports isotopiques naturels.
4. COMMENT MONTRER LA FIDELITE DES JUVENILES DE BARS AUX DIFFERENTES NOURRICERIES ?
4.1. Reconstitution de l'histoire de vie des juvéniles de bars : détermination des âges, histoire
océanique et estuarienne (microstructure de l'écaille et de l'otolithe).
4.2. Formes, structures et utilisations des écailles de poissons.
4.3. Formes, structures et utilisations des otolithes.
4.4. Identification de contingent (signatures microchimiques).
5. COMMENT MONTRER LA PARTICIPATION DE CES CONTINGENTS DE JUVENILES AUX STOCKS COTIERS DE
GENITEURS ?
5.1. Utilisation des signatures microchimiques des otolithes.
6. PLAN DE L'ETUDE.
TOME 1 : ETUDE COMPAREE DES PEUPLEMENTS DE POISSONS DE COMPLEXES
ESTUARIENS DE LA FACADE OUEST DE LA FRANCE.
PREMIERE PARTIE : STRUCTURATION DES COMMUNAUTES DE POISSONS DES
COMPLEXES ESTUAIRES - MARAIS SALES INTERTIDAUX DE LA FAÇADE OUEST DE LA
FRANCE.
CHAPITRE 1 : STRUCTURATION DU PEUPLEMENT DE POISSONS D'UN PETIT COMPLEXE
ESTUAIRE - MARAIS SALES ENCLAVE DE LA FAÇADE OUEST DE LA FRANCE : LA BAIE DE
SAINT-BRIEUC.
1. INTRODUCTION.
2. MATERIEL ET METHODE.
2.1. Présentation du site d'étude.
2.2. Echantillonnages
3. RESULTATS.
3.1. Description générale du peuplement.
3.1.1. Guildes écologiques (Elie et al. 1990; Keith et Allardi 2001).
3.1.2. Structuration des effectifs et de la biomasse.
3.1.3. Structure démographique globale.
3.2. Variations spatiales de la structure du peuplement.
3.2.1. Site Amont, Clôture. .
3.2.2. Site Aval, Nature.
3.2.3. Comparaison entre le site 1 et le site 2 : Abondances numériques et pondérales.
3.2.4. Comparaison entre le site 1 et le site 2 : Comparaison de la structuration par guildes écologiques.
3.3. Variations temporelles de la structure du peuplement.
4. DISCUSSION.
4.1. Preferundum et guildes écologiques.
4.2. Colonisation des marais salés et rôle trophique.
4.3. Activités de gestion et perturbations des relations espaces-espèces.
4.4. Variations temporelles de la structure du peuplement à microéchelle.
5. CONCLUSION.
6. REMERCIEMENTS.
CHAPITRE 2 : EVOLUTION DES ASSEMBLAGES DES ESPECES DE POISSONS DES MARAIS
MACROTIDAUX DE LA BAIE DU MONT SAINT-MICHEL 1998-2003. .
1. INTRODUCTION.
2. MATERIEL ET METHODE.
2.1. Présentation des sites d'étude..
2.2. Echantillonnages.
2.3. Evolution des populations échantillonnées.
3. RESULTATS.
3.1. Description générale du peuplement.
3.1.1. Guildes écologiques (Elie et al. 1990).
3.1.2. Structuration des effectifs et de la biomasse.
3.1.3. Structure démographique globale.
3.2. Variations saisonnières du peuplement piscicole.
3.2.1. Site du Polder Foucault, Le Ponton.
3.2.2. Site du Polder Tesnière.
3.3. Variations interannuelles.
3.3.1. Le site du Ponton
3.3.2. Le site de Tesnière.
3.4. Evolution de la composition globale du peuplement des deux sites depuis le processus invasif par le
Chiendent.
3.5. Evolution de l'abondance de certaines espèces composant le peuplement de poissons
4. DISCUSSION.
4.1. Etat 2003 de l'assemblage piscicole des marais macrotidaux.
4.2. Evolutions des relations espaces-espèces.
4.3. La baie du Mont Saint-Michel, une baie aux multiples contraints.
5. CONCLUSION.
6. REMERCIEMENTS
CHAPITRE 3 : LES NOURRICERIES LIGERIENNES DE DONGES AU BANC DE PIPY. ETAT 2003.
1. INTRODUCTION.
2. MATERIEL ET METHODE.
2.1. Présentation des sites d'étude.
2.1.1. Echantillonnages et Conditions de chalutages.
2.1.2. Traitements des captures et résultats.
3. RESULTATS. =
3.1. Description générale du peuplement.
3.1.1. Guildes écologiques (Elie et al. 1990).
3.1.2. Structuration des effectifs et des biomasses.
3.1.3. Structure démographique globale.
3.2. Analyse de la structuration temporelle des assemblages piscicoles.
3.2.1. Abondances numériques.
3.2.2. Abondances pondérales
3.3. Analyses de la structuration spatiale des assemblages piscicoles.
3.3.1. Abondances numériques.
3.3.2. Abondances pondérales.
4. DISCUSSION.
4.1. Peuplement de poissons, diversité et fonctionnalité estuarienne.
4.2. Répartition du peuplement de poissons.
5. CONCLUSION
6. REMERCIEMENTS.
CHAPITRE 4 : IMPACTS DES MODIFICATIONS DE LA STRUCTURE DE LA VEGETATION DES
MARAIS SALES TIDAUX DE L'EUROPE DE L'OUEST SUR LA FONCTION DE NOURRICERIE.
1. RESUME .
1. ABSTRACT
2. INTRODUCTION.
3. MATERIAL AND METHODS :
3.1. Description of study sites :.
4.3. Temporal variations in the fish population of the Aiguillon bay :
4.4. Spatial variations in the fish population of the Aiguillon bay :
4.5. Composition of the fish population of the Mont Saint-Michel bay :
4.6. Seasonal comparison of the two fish populations (Aiguillon compared to Mont Saint-Michel) :
136
5. DISCUSSION.
5.1. The Aiguillon bay and the Mont Saint-Michel bay, two models of nurseries :
5.2. Management activities, disturbance and the nursery function of Aiguillon bay :
5.3. Salt marshes, nursery function and colonising guilds :
6. CONCLUSION
7. ACKNOWLEDGEMENTS :.
SECONDE PARTIE : APPLICATION DE LA CLASSIFICATION EN GUILDES COLONISATRICES
AUX PEUPLEMENTS DE POISSONS DE QUATRE COMPLEXES ESTUAIRES - MARAIS SALES
INTERTIDAUX DE LA FAÇADE OUEST DE LA FRANCE.
GUILDES COLONISATRICES, CONTEXTES METAECOSYSTEMIQUES ET COLONISATION
DES EAUX DE TRANSITION.
1. INTRODUCTION.
1.1. Tactiques et stratégies d'histoire de vie.
1.2. Stratégies reproductrices.
2. MATERIEL ET METHODE.
2.1. Description de la méthodologie de définition des guildes colonisatrices (D'après Parlier et al.
2006) :
2.2. Description des sites d'étude :
2.3. Description du contexte métaécosystémique :
3. RESULTATS.
3.1. Guildes colonisatrices présentes dans les marais salés intertidaux.
3.2. Utilisation des zones estuariennes et plasticités spécifiques.
(i) Espèces présentes dans un seul site :
(ii) Espèces présentant une stabilité du comportement de colonisation :
(iii) Espèces présentant une plasticité de comportement de colonisation baie vs Loire :
4. DISCUSSION.
4.1. Plasticité spécifique et tactiques alternatives de colonisation des complexes estuariens.
4.2. Pertinence de la classification en guildes colonisatrices (Parlier et al. 2006).
5. CONCLUSION
TOME 2 : ETUDE ET CARACTERISATION DE LA FONCTION DE NOURRICERIE DE
COMPLEXES ESTUARIENS DE LA FACADE OUEST DE LA FRANCE POUR LE BAR
EUROPEEN.
INTRODUCTION.
1.1. Description du cycle biologique du bar européen
1.2. Méthodologie de description de la fonction de nourricerie :
CHAPITRE 1 : VARIATIONS REGIONALES DES PERFORMANCES DE CROISSANCE ET DE
FREQUENTATION DES NOURRICERIES LITTORALES PAR LES BARS JUVENILES
(DICENTRARCHUS LABRAX L. A.K.A. MORONE LABRAX).
1. INTRODUCTION.
2. MATERIEL ET METHODE.
2.1. Caractéristiques des sites étudiés .
2.1.1. Estuaire de la Seine.
2.2. Autres sites.
2.3. Comparaisons effectuées.
3. RESULTATS.
3.1. Première colonisation estuarienne .
3.1.1. Analyse synchronique
3.1.2. Analyse diachronique
3.2. Phénologie et pérennité de la fréquentation
3.3. Abondances.
3.3.1. Variations interannuelles intra site des abondances moyennes.
3.3.2. Abondances maximales.
3.4. Performances de croissance.
4. DISCUSSION
5. CONCLUSION.
6. REMERCIEMENTS
CHAPITRE 2 : LES MARAIS SALES CONTRIBUENT-ILS SIGNIFICATIVEMENT A LA
CROISSANCE DES BARS DE L'ANNEE (GROUPE 0) (DICENTRARCHUS LABRAX A.K.A.
MORONE LABRAX) ?
1. INTRODUCTION : .
2. MATERIEL & METHODE : .
2.1. Sites d'étude:
2.1.1. Protocole de capture et traitements des données :
3. RESULTATS :
3.1. Cinétique de colonisation :
3.2. Contenus stomacaux :
3.3. Rations instantanées :
3.4. Analyses isotopiques :
3.4.1. Description et Evolution des signatures
4. DISCUSSION :
5. CONCLUSION :
6. REMERCIEMENTS :
CHAPITRE 3 : DISCRIMINATION DE QUATRE NOURRICERIES DE BARS (DICENTRARCHUS
LABRAX L.) DE LA FAÇADE OUEST DE LA FRANCE PAR MICROCHIMIE DES OTOLITHES.
1. RESUME
2. INTRODUCTION
3. MATERIEL ET METHODE
3.1. Présentation du site d'étude.
3.2. Extraction et préparation des échantillons.
4. RESULTATS.
4.1. Caractérisation de la population de juvéniles de bars européens.
4.2. Analyses microchimiques des otolithes.
5. DISCUSSION
6. CONCLUSION.
CHAPITRE 4 : RECONSTITUTION DE L'HISTOIRE DE VIE DES JEUNES BARS
(DICENTRARCHUS LABRAX L.) DE QUATRE NOURRICERIES LITTORALES DE LA FAÇADE
OUEST DE LA FRANCE PAR OTOLITHOCHRONOLOGIE.
1. INTRODUCTION.
2. MATERIEL ET METHODE
2.1. Présentation du site d'étude.
2.1.1. Localisation des sites de prélèvements.
2.1.2. Caractéristiques des sites de prélèvements.
2.2. Extraction et préparation des échantillons.
2.2.1. Préparation des otolithes et détermination des âges.
2.2.2. Mise en évidence des stries journalières.
3. RESULTATS.
3.1. Validation des stries journalières .
3.2. Description de l'organisation des stries
3.3. Structure et origine des 'sillons'.
3.4. Comparaison des histoires de vie
3.5. Recrutement et gradient biogéographique.
3.6Histoires de vie et colonisation intertidale
4. DISCUSSION
4.1. Stries journalières et marques de stress.
4.2. Histoires de vie et colonisation intertidale. .
5. CONCLUSION
6. REMERCIEMENTS
CONCLUSION GENERALE ET PERSPECTIVES.
1. ETUDE DES COMPLEXES ESTUAIRES - MARAIS SALES INTERTIDAUX DE LA FAÇADE OUEST DE LA FRANCE.
253
1.1. Objectifs de ce travail.
1.2. Mise en perspective du travail de thèse.
1.1.1. Etude des peuplements.
1.1.2. Etude spécifique du bar européen.
2. PERSPECTIVE DE TRAVAUX ET CONSEILS DE GESTION
2.1. Pérennité de telles études.
2.2. Poursuite de travaux et perspectives.
LITTERATURE CITEE
ANNEXES :.
ANNEXE 1 : DESCRIPTION DE LA PHYLOGENIE DU BAR EUROPEEN
Mot(s) clé(s) : écosystème, espèces patrimoniales, poissons